Επίλυση Όλων Των Προβλημάτων Των Παραθύρων Και Άλλων Προγραμμάτων

Οι υπολογιστές βοήθησαν στην πρόοδο στην ανάλυση αλληλουχίας του ανθρώπινου γονιδιώματος

ITworld.com -

Σε συνέντευξη Τύπου του Λευκού Οίκου τη Δευτέρα, η δημόσια κοινοπραξία Human Genome Project και η Celera Genomics, μια ιδιωτική εταιρεία, ανέφεραν από κοινού ότι είχαν συγκεντρώσει προσχέδια εργασίας της αλληλουχίας του ανθρώπινου γονιδιώματος. Η παρουσία των δύο ομάδων στο ίδιο βάθρο σηματοδότησε μια προφανή ανακωχή σε μια απελπιστική ώθηση να ανακοινωθεί πρώτος μια ακολουθία αποκωδικοποιημένου ανθρώπινου γονιδίου.



Αν και αντιπροσωπεύει μια σημαντική ανακάλυψη στην επιστημονική μάθηση, το έργο του γονιδιωματικού ντετέκτιβ αντιπροσωπεύει επίσης κάτι το επίτευγμα στις σύγχρονες τεχνικές υπολογιστών. Χρησιμοποιήθηκε κατανεμημένη τεχνολογία υπολογιστών και βάσεων δεδομένων, καθώς και προηγμένο λογισμικό αναζήτησης και άλλες τεχνολογίες για να επιτευχθεί ο στόχος της αποκάλυψης του βασικού σχεδίου για την ανθρώπινη ζωή.



Η εργασία για τη δημιουργία ενός γενετικού σχεδίου για έναν άνθρωπο αποκάλυψε συνολικά 3,12 δισεκατομμύρια ζεύγη βάσεων στο ανθρώπινο γονιδίωμα. Ένα συναρμολογημένο γονιδίωμα περιγράφεται ως ένα στο οποίο είναι γνωστή η θέση και η σειρά των γραμμάτων του γενετικού κώδικα κατά μήκος των χρωμοσωμάτων. Οι υπολογιστές βασίζονται για την αποκάλυψη αντιστοιχιών σε αλληλουχίες DNA που χρησιμεύουν για την αποκάλυψη του κώδικα.

Ορισμένοι παρατηρητές προτείνουν ότι το έργο οδηγεί στη δημιουργία ενός νέου πεδίου τεχνολογίας γνωστής ως βιοπληροφορική. Λένε ότι μια νέα πειθαρχία προκύπτει από το γάμο της επιστήμης των υπολογιστών και της βιολογίας.



Από την πλευρά της, η Celera έχει συνδέσει αλληλουχίες DNA με μια υπερυπολογιστική μονάδα με 800 διασυνδεδεμένα συστήματα υπολογιστών που βασίζονται σε Compaq Alpha, καθένα από τα οποία είναι ικανό να εκτελεί περισσότερες από 250 δισεκατομμύρια συγκρίσεις ακολουθιών ανά ώρα. Η Celera συνεργάζεται με την Oracle για την ανάπτυξη βάσεων δεδομένων.

ποιο ειναι το προγραμμα μου για αυριο

«Το όλο εγχείρημα αφορούσε την απόκτηση και αποθήκευση πληροφοριών», δήλωσε ο Bruce Birren, βοηθός διευθυντή του Whitehead Sequencing Center στο Cambridge, Μασαχουσέτη, βασικός συμμετέχων στην Κοινοπραξία Ανταλλαγής Ανθρώπινου Γονιδιώματος.

«Διαβάσαμε τον κωδικό τεσσάρων γραμμάτων που αντιπροσωπεύει το βιβλίο της ζωής», είπε ο Birren, αναφερόμενος στον κωδικό τεσσάρων γραμμάτων που αντιστοιχεί στα τέσσερα βασικά χημικά συστατικά του DNA. «Πάντα μελετούσαμε ένα γονίδιο τη φορά, αλλά η οπτική μας αλλάζει επειδή τώρα βλέπουμε ολόκληρο το τοπίο. Αυτό απαιτεί υπολογιστική ικανότητα ».



Υπάρχει ακόμη σημαντική αναλυτική εργασία που πρέπει να γίνει στον τομέα, καθώς οι ερευνητές προσπαθούν να εδραιώσουν πιθανούς δεσμούς μεταξύ συγκεκριμένων γονιδίων και συγκεκριμένων χαρακτηριστικών. Αυτό το επόμενο στάδιο εργασίας μπορεί να υπολογίζεται ότι θα οδηγήσει σε περαιτέρω υπολογιστικές προόδους, ακόμη και όταν οι υπολογιστικές προόδους οδηγούν τη χαρτογράφηση του γονιδιώματος προς τα εμπρός.

«Τώρα περνάμε σε μια φάση όπου η ερμηνεία των [γενετικών] πληροφοριών θα απαιτήσει νέα εργαλεία ανάλυσης», είπε ο Birren. Οι ερευνητές χρησιμοποιούν ήδη ένα μείγμα διαφορετικών προηγμένων τεχνολογιών λογισμικού - συμπεριλαμβανομένων νευρωνικών δικτύων, ασαφούς λογικής και εξομάλυνσης δεδομένων - για να αποκαλύψουν μοτίβα στα γενετικά δεδομένα.

Θα είναι επίσης απαραίτητο να ταιριάζουν προσεκτικά τα εργαλεία λογισμικού ανάλυσης και διαχείρισης δεδομένων, δήλωσε ο Michael Roberson, διευθυντής προγράμματος στο Ινστιτούτο SAS στο Cary, N.C.

«Ένας από τους τομείς όπου το λογισμικό SAS χρησιμοποιείται εδώ και πολύ καιρό ήταν στον τομέα των κλινικών δοκιμών», είπε.

το καλύτερο πρόγραμμα περιήγησης αρχείων για το android

Σε ένα επίπεδο, εξήγησε ο Roberson, ο χειρισμός και η διαχείριση γενετικών δεδομένων είναι παρόμοια με τα παραδοσιακά καθήκοντα εξόρυξης δεδομένων και αποθήκευσης δεδομένων. Υπάρχουν όμως διαφορές.

«Στην εργασία του ανθρώπινου γονιδιώματος, η αποθήκευση δεδομένων γίνεται πιο περίπλοκη από το γεγονός ότι τα δεδομένα είναι πολύ ακανόνιστα και πολύ μεγάλα», είπε. «Όταν εξετάζετε αυτά τα δεδομένα σε σχέση με δεδομένα κλινικών δοκιμών, είναι πολύ πιο δύσκολο να πάρετε πληροφορίες από πολλές πηγές και να τις συνδυάσετε όπως θα κάνατε, για παράδειγμα, με μια παραδοσιακή βάση δεδομένων πληροφοριών πιστωτικών καρτών. Είναι δύσκολο να δουλέψεις, γιατί οι [τεχνικές που σχετίζονται με τη] συλλογή δεδομένων τείνουν να είναι διαφορετικές για κάθε υποκείμενο ».

Ο Roberson είπε ότι η ομάδα του εξετάζει τη νέα τεχνολογία γνωστή ως εξομάλυνση δεδομένων, η οποία χρησιμοποιεί τεχνικές αναγνώρισης προτύπων για να σβήσει τους πραγματικούς γενετικούς δείκτες εν μέσω θορυβωδών συνόλων δεδομένων. Τον Μάιο, το Ινστιτούτο SAS διέκοψε την iBiomatics LLC ως θυγατρική εξ ολοκλήρου για να καλύψει συγκεκριμένα τις υπολογιστικές ανάγκες των ερευνητών στην αναδυόμενη βιομηχανία της επιστήμης της ζωής.

Σύνδεσμοι προς σχετικές πληροφορίες υπολογισμού γονιδιώματος στο Δίκτυο ITworld.com

'Το SAS βοηθά τους επιστήμονες να αποκρυπτογραφήσουν τον ανθρώπινο γενετικό κώδικα', Brad Shewmake ( Infoworld, 12 Ιουνίου 2000)

'Writing the Book of Life', Louise Fickel ( CIO, 1 Μαρτίου 2000)

«Δημιουργία καριέρας στη Βιοπληροφορική», Dawn Levy ( InfoWorld συμπλήρωμα, 30 Ιουλίου 1999)

Σύνδεσμοι με άλλες υπολογιστικές πληροφορίες γονιδιώματος

Υπολογισμός του γονιδιώματος

γιατί το τηλέφωνό μου λέει συνέχεια δεν υπάρχει χώρος αποθήκευσης

Εισαγωγή στον υπολογισμό του ανθρώπινου γονιδιώματος μέσω του World Wide Web

Εθνικά Ινστιτούτα Υγείας (NIH)

The Bioinfomatics Gold Rush ( Scientific American, Ιούλιος 2000)

Αυτή η ιστορία, «Οι υπολογιστές βοήθησαν στην πρόοδο στην αλληλουχία ανθρώπινου γονιδιώματος» δημοσιεύτηκε αρχικά από τονITworldΕ

Επιλογή Συντάκτη

Microsoft Office για τηλέφωνα ANDROID: Ναι! Κατεβάστε δωρεάν (κάπως)

Θέλετε το Microsoft Office στο Android smartphone σας; Λοιπόν εδώ. Και είναι εντελώς δωρεάν - αλλά με ορισμένες λειτουργίες επί πληρωμή. Φοβερο...

Ο αντίπαλος της Google Foundem παροτρύνει την ΕΕ να απορρίψει τα ένδικα μέσα

Ένας ανταγωνιστής της Google που υπέβαλε καταγγελία κατά του κολοσσού αναζήτησης δήλωσε την Τρίτη ότι οι προτάσεις της εταιρείας για την αντιμετώπιση των αντιμονοπωλιακών ανησυχιών της Ευρωπαϊκής Επιτροπής δεν κάνουν κάτι τέτοιο.

Σφάλμα ενημέρωσης των Windows 0xc1900104

Γεια, οπότε προσπαθώ να ενημερώσω τον φορητό υπολογιστή μου στα Windows 10 έκδοση 1803 και συνεχίζω να λαμβάνω σφάλμα 0xc1900104. Έχω τρέξει το εργαλείο αντιμετώπισης προβλημάτων πολλές φορές, αλλά αυτό δεν βοήθησε καθόλου δυστυχώς. διαβάζω

Συμβουλή για Windows: Επίλυση διενέξεων διευθύνσεων IP

Το Computerworld καλύπτει μια σειρά τεχνολογικών θεμάτων, με έμφαση σε αυτούς τους βασικούς τομείς της πληροφορικής: Windows, Mobile, Apple/enterprise, Office και σουίτες παραγωγικότητας, συνεργασία, προγράμματα περιήγησης στο Web και blockchain, καθώς και σχετικές πληροφορίες για εταιρείες όπως η Microsoft, η Apple και Google.

Θέλω Να Κλάψω

Θέλω Να Κλάψω